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广州军区广州总医院(现名南部战区总医院)做一次试管婴儿的费用因多种因素而异，括前期检查费用、促排药物费用、手术和实验室操作费用等。以下是基于现有信息的一个大致预估，但请注意，实际费用可能会因个体差异、治疗方案以及医疗技术的更新而有所变动。

1. 前期检查费用：

这部分费用括夫妻双方的基础体检、激素水平检查、输管造影等项目。

费用通常在5000元至8000元不等。

2. 促排药物费用：

促排药物费用是影响整体费用波动的主要因素。

由于每位患者的体质不同，所需药物剂量和种类也有差异，费用范围从1万元至2万元不等。

进口药物相对昂贵，但其效果和副作用较好，因此部分患者会使用进口药物。

. 手术和实验室操作费用：

这部分括子集、子处理、胚胎培养和移植等费用。

根据所技术的复杂程度，费用大约在2万元至3万元之间。

如果更的囊胚培养技术或第三代试管婴儿(PGD/PGS)查技术，费用会增加，但成功率也会相应高。然而，需要注意的是，广州军区广州总医院(南部战区总医院)目前没有开展第三代试管婴儿项目，因此无法直接该项目的具体费用。

综上所述，如果在广州军区广州总医院(南部战区总医院)做一次试管婴儿，且的是代或第二代技术，总费用预计在4万元至6万元之间。但请注意，这只是一个大致的预估范围，实际费用可能会因患者个体差异、治疗方案以及医疗技术的更新而有所变动。

此外，对于需要做第三代试管婴儿的患者，建议前往其他具备相关资质的医院，如中山大学附属医院、广州医科大学附属第三医院或广东省妇幼保健院等，以获取更准确的价格信息和专业的医疗服务。同时，考虑到试管婴儿的成功率及其带来的额外费用，患者在决定进行试管婴儿治疗前应与医生进行详细的沟通和评估，以确定适合自己的治疗方案和预算。