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北京做三代试管婴儿的费用存在一定差异，具体如下：

术前检查费用一般在2000到3000左右。

初诊费一般在500-1000元左右。

三代试管婴儿手术操作费则根据实际情况而定，一般在20000-50000元左右。

具体费用因医院、医生、三代试管方案等因素而有所不同，建议咨询当地医院或专业人士了解详情。