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1.巢过度刺激综合征（OHSS）。

常见，是人体对促排药物的过度反应。由于患者要接受大剂量的促腺激素，像年轻、瘦小及多囊巢患者，对促腺激素反应敏感，可出现巢过度刺激症状群，如巢增大、腹水、胸水、少尿、胸闷等，严重的需入院治疗。

2.多胎妊娠。

因正常情况下移植3～4个胚胎，多胎妊娠率高，发生率约20%。随着妊娠胎数的增加，母亲的妊娠并发症发生率高，如妊高症、胎膜早破、产后出血等。

胎儿易出现早产、宫内发育迟缓，新助怀孕易发生窒息、体重偏大，从而可能影响新助怀孕的生长和发育；

3.异位妊娠；

4.盆腔感染；

5.超声引导取时阴道出血；

6.其他：巢扭转引起的急腹症。

虽然，三代试管婴儿过程存在可能的并发症，但是通过积极的治疗，预后一般较好。